Potensi bahaya pembersih enjin kepada enjin terletak pada keupayaan melarutnya yang kuat. Jika pemilik kenderaan menggunakan pembersih enjin secara berlebihan, ia boleh menyebabkan kerosakan pada pengedap dalaman dan badan silinder enjin. Selain itu, jika sejumlah besar sisa pembersih enjin kekal di dalam enjin selepas dibersihkan, ia boleh menjejaskan keseimbangan komponen minyak, yang membawa kepada prestasi minyak yang merosot.
Pembersih enjin berkesan untuk kenderaan dengan perbatuan rendah dan pembentukan karbon ringan serta pengumpulan enap cemar di dalam enjin. Apabila ditambah dalam keadaan sedemikian, ia boleh memberi kesan pembersihan dengan membuang mendapan karbon dan enap cemar, menambah baik aliran minyak baharu, menurunkan suhu dan bunyi enjin, meningkatkan prestasi pelinciran, dan mengurangkan haus, seterusnya memanjangkan jangka hayat enjin.
Walau bagaimanapun, bagi kenderaan yang mempunyai pengumpulan kotoran yang berat, kesan pembersihan penambahan pembersih enjin mungkin tidak begitu ketara. Semasa proses pembersihan, pelepasan semula dan peredaran kotoran boleh menyebabkan saluran minyak tersumbat, pelinciran yang lemah, atau malah sawan galas. Oleh itu, pemilik kenderaan harus menilai keadaan penggunaan kenderaan mereka sebelum membuat keputusan sama ada untuk menggunakan pembersih enjin.
Dari segi penyelenggaraan enjin, adalah penting bagi pemilik kenderaan untuk mematuhi jadual penyelenggaraan yang dinyatakan dalam manual pemilik mereka dan melakukan penyelenggaraan tetap. Penggantian atau penambahan minyak enjin tepat pada masanya adalah penting, dan jika penapis menunjukkan tanda-tanda tersumbat, ia harus diganti dengan segera untuk mengelakkan pencemaran dalaman dan kehausan enjin yang dipercepatkan.
